标题拼写错误无法修改，特此解释并道歉。今天是第1348期日报。
Science：菌群或非传染病中的传染性成分(观点)
Science[IF:41.037]
① 非传染病（NCD）与菌群失衡有关，个体之间的密切接触可以塑造菌群组成NCD可通过菌群移植传递给健康宿主；② 肥胖（NCD风险因素)具有社会传播特征，2型糖尿病和炎症性肠病NCD由于菌群与环境和遗传因素密切相关，患者配偶患病风险增加，可能与失衡菌群的传播有关，研究中难以完全剥离；③ 对于传染病，科赫法则可以用来检测微生物的致病性，类似的假设也可以用来检测不平衡的菌群NCD传染性的作用。
Are noncommunicable diseases communicable?
01-17, doi: 10.1126/science.aaz3834主编评论在过去的一个世纪里，人类传染病得到了有效的控制，而不是传染病（如心血管代谢疾病和癌症等慢性病）正变得越来越普遍。越来越多的证据表明，许多非传染病都与肠道菌群紊乱有关。Science根据最新的观点，致病微生物可以在个体之间传播，肠道菌群紊乱也可以在个体之间传播，从而使非传染病也具有传染性。这一观点为传统的非传染病概念增添了新的元素，或为这些疾病的预防和治疗带来了新的启示。（@mildbreeze）
肠菌脂多糖移位或促进心肌梗死患者动脉血栓形成
European Heart Journal[IF:23.239]
① 与稳定型心绞痛相比，ST心肌梗死段升高（STEMI）脂多糖是脂多糖（LPS）和sP-选择素(血小板活化标志物)浓度升高，肠道通透性标志物zonulin浓度上升并与LPS相关；② STEMI在冠状动脉血栓中，Toll样受体4（TLR组织蛋白酶G、LPS阳性分别为100%、80%、25%；③ 给小鼠注射大肠杆菌LPS，这种现象可以增强动脉血栓形成和血小板活化TLR4抑制剂减弱；④ 体外试验表明，LPS通过TLR为了增强血小板酶G活化，增强血小板聚集。
Low-grade endotoxaemia enhances artery thrombus growth via Toll-like receptor 4: implication for myocardial infarction
01-03, doi: 10.1093/eurheartj/ehz893脂多糖（LPS）它是肠道菌群的一部分，可以在血液中检测到（在一定程度上是内毒素血症），但其在血栓形成中的作用尚不完全清楚。European Heart Journal本研究发现，心肌梗死（MI）在冠状动脉血栓形成患者中，LPS和TLR4阳性与低毒素血症、血小板活化和肠道渗透有关。将大肠杆菌输注到小鼠身上LPS来模拟MI低度内毒素血症增强了小鼠的血栓形成，可以发挥这种作用TLR抑制剂减弱。这些发现说明，MI患者肠道通透性增加，导致肠道通透性增加LPS移位进入血液循环，最终通过白细胞-血小板互动在动脉病变部位形成血栓形成。（@mildbreeze）
真菌鉴定ITS数据库UNITE—处理未分类和并行分类
Nucleic Acids Research[IF:11.147]
① UNITE目前数据库是真菌ITS基于数百万的全长，整理最全面的数据库ITS包括45万多个假设物种在内的高质量序列；② 假定物种包括DOI在论文中提供独特性很方便；③ 新整合部分ITS2和PacBio高通量数据，并改进末分类物种注释；④ 主流分析流程数据库QIIME、Mothur和USEARCH制作相应格式的文件，使用方便；⑤ UNITE数据库是由真菌学开源的开放访问计划(Mycological)社区驱动。
The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications
2018-10-29, doi: 10.1093/nar/gky1022【主编评论】UNITE（https://unite.ut.ee）是真菌分子鉴定数据库和序列管理环境。其目标是形成正式的真菌条形码-核糖体内转录间隔（ITS）提供所有~100000公共真菌ITS参考序列。它也是一系列扩展子(宏条码)分析过程的数据提供商，定期与所有主要真菌序列数据库和其他社区资源交换数据。最近的改进包括重新设计不可分类假设物种的处理方案，整合全球生物多样性信息设施的分类主体，支持不限数量的并行计算分类系统。（@刘永新-中国科学院遗传发展研究所-宏基因组
细胞外酶-化腐烂为神奇的催化剂
Bioresource Technology[IF:6.669]
① 堆肥是指高温条件下固体有机基质的生物降解过程，碳氮比可提高堆肥效率；② 细菌群落组成在堆肥过程中的变化是由环境条件和基质组成的变化驱动的，堆肥处理和阶段影响细菌群落；③ 微生物降解有机废物主要通过水解外酶的活性来实现，酶的变化与细菌群落的演变有关；④ 与关键类群相关的功能酶提高了堆肥效率；⑤ C/N酶活性是通过改变细菌群落的组成和关键类群的相对丰度来改变的。
Key extracellular enzymes triggered high-efficiency composting associated with bacterial community succession
2019-05-27, doi: 10.1016/j.biortech.2019.121576堆肥是一个极其复杂的物理化学变化过程，包括微生物群落的演变和复杂有机成分的降解。本文在不同的开始C/N监测堆肥过程中关键细菌群和细胞外酶的演变过程以及有机物的转化，详细阐述了特定细菌群驱动的高效堆肥的特点和机制，确定了最佳C/N促进高效堆肥的范围和潜在的关键微生物种类。作者详细解释了整个堆肥过程的每个时期，通读本文可以使我们对整个堆肥过程有更深入的了解。作者详细解释了整个堆肥过程的每个时期，通读本文可以使我们对整个堆肥过程有更深入的了解。（@刘永新-中国科学院遗传发展研究所-宏基因组
健康饮食缓解膝关节炎
American Journal of Clinical Nutrition[IF:6.568]
① 2757年膝骨关节炎（KOA）患者分析发现，坚持西方饮食模式和增加的患者KOA放射学与症状进展有关，坚持谨慎的饮食模式会减少进展；② 西方饮食模式分数增加，Kellgren–Lawrence （KL）高安大略省西部和麦克马斯特大学关节炎指数恶化（WOMAC）增加发展的可能性，关节间隙宽度（JSW）损失不受影响；③ 谨慎饮食模式分数增加，KL恶化风险和JSW同时减少损失WOMAC增加发展的可能性降低；④ KOA患者可多吃蔬菜、水果、鱼、全谷物、豆类等。
Dietary Patterns and Progression of Knee Osteoarthritis: Data from the Osteoarthritis Initiative
01-07, doi: 10.1093/ajcn/nqz333研究比较了西方饮食模式和谨慎饮食模式对膝关节炎的影响。结果表明，西方饮食模式增加了膝关节炎的风险，而谨慎的饮食模式可以降低膝关节炎的风险。饮食模式会影响膝关节炎的发生和发展风险。（@兵兵）
喝咖啡或减肥
American Journal of Clinical Nutrition[IF:6.568]
① 126非胰岛素敏感性（HOMA-IR ≥1.30)对超重个体进行为期24周的随机安慰剂对照试验；② 62名参与者每天摄入4杯速溶咖啡，其余64名参与者每天摄入4杯咖啡样安慰剂饮料；③ 与安慰剂组相比，咖啡摄入对胰岛素敏感性、空腹血糖和胰岛素抵抗的生物介质，如血浆脂联素，无明显影响；④ 咖啡摄入组参与者的脂肪量比安慰剂组低3.7%，尿肌酐浓度降低21.2%。
The effect of coffee consumption on insulin sensitivity and other biological risk factors for type 2 diabetes: a randomized placebo-controlled trial
2019-12-31, doi: 10.1093/ajcn/nqz306主编评论一项随机控制试验侧重于每天摄入4杯速溶咖啡对血糖代谢的影响。研究结果表明，咖啡的摄入对胰岛素敏感性、空腹血糖和胰岛素抵抗相关生物介质没有显著影响。然而，咖啡的摄入量导致体脂减少，具体机制尚不清楚。（@兵兵）
膳食纤维的减肥效果
American Journal of Clinical Nutrition[IF:6.568]
① 文章来源于62个实验，共涉及3877名参与者；② 结果表明，粘性纤维的摄入量可以减轻体重（−0.33 kg）、身体质量指数（BMI，−0.28kg/m2）和腰围（−0.63 cm），但对体脂没有影响；③ 粘性纤维在超重、糖尿病或代谢综合征患者中的减肥效果更为显著；④ 粘性纤维对腰围和体脂有很强的证据影响，对体重有中等证据，对BMI证据影响最弱；⑤ 膳食粘性纤维能显著减轻体重，与其他肥胖指标无关。
Can dietary viscous fiber affect body weight independently of an energy-restrictive diet? A systematic review and meta-analysis of randomized controlled trials
01-03, doi: 10.1093/ajcn/nqz292主编评论截至2019年，文章已收集.7.关于膳食粘性纤维和体重的62项相关研究(干预时间超过4周)于24日前发表。根据数据分析，粘性纤维的摄入可以减轻体重等肥胖指标，与热量限制无关。此外，本文还确定了相关证据的确定性GRADE评定。以膳食纤维的粘度为指标，而不是其可溶性。文章推荐的粘性纤维摄入量为6.7g/d。（@兵兵）
早期母婴分离可诱导产生适当的产生IBS小鼠模型
Brain Behavior and Immunity[IF:6.17]
① 野生小鼠和IL每天连续310-/-小鼠h的母婴分离（MS），干预10天；② MS肠易激综合征出现在诱导的成年野生小鼠身上（IBS）主要特点：肠道渗透性、内脏敏感性高、菌群紊乱、胆汁酸吸收不良、潘氏细胞及ILC肠道低度炎症与缺陷有关；③ 但MS不会诱导IL10-/-小鼠引起或加重结肠炎；④ MS野生小鼠对胃肠道感染的敏感性不会增加；⑤ MS诱导的小鼠是模拟IBS良好的实验模型，不诱发易感个体结肠炎或野生小鼠胃肠道感染。
Early life stress in mice is a suitable model for Irritable Bowel Syndrome but does not predispose to colitis nor increase susceptibility to enteric infections
2018-05-31, doi: 10.1016/j.bbi.2018.05.024【主编评论】Brain, Behavior and Immunity对新生小鼠进行母婴分离干预的最新研究可诱导小鼠产生肠易激综合征（IBS）相关特征，不会引起小鼠结肠炎，也不会增加小鼠肠道感染的易感性，可作为研究IBS实验模型。（@沈志勋）
感谢本日报的创作者：mildbreeze，爱的选择，刘永新-中科院遗传发展所-宏基因组，王文东，兵兵，this little piggy
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